Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med28Q920D3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms