Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Hoxc12Q8K5B8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hoxc12Q8K5B8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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