Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms