Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrtm1Q8K377 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrtm1Q8K377 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrtm1Q8K377 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrtm1Q8K377 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Lrrtm1Q8K377 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Lrrtm1Q8K377 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Lrrtm1Q8K377 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrtm1Q8K377 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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