Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms