Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Abcf3Q8K268 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Abcf3Q8K268 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Abcf3Q8K268 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Abcf3Q8K268 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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