Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek9Q8K1R7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek9Q8K1R7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek9Q8K1R7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek9Q8K1R7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek9Q8K1R7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Nek9Q8K1R7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nek9Q8K1R7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nek9Q8K1R7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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