Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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SbsnQ8CIT9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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SbsnQ8CIT9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SbsnQ8CIT9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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SbsnQ8CIT9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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