Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Phc3Q8CHP6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Phc3Q8CHP6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms