Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brf1Q8CFK2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brf1Q8CFK2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms