Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms