Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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