Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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