Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fbxo48Q8CAT8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fbxo48Q8CAT8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fbxo48Q8CAT8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fbxo48Q8CAT8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fbxo48Q8CAT8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms