Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
BC049762Q8C601 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms