Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnot2Q8C5L3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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