Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms