Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hdac7Q8C2B3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms