Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ctdsp2Q8BX07 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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