Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssc5dQ8BV57 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ssc5dQ8BV57 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ssc5dQ8BV57 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms