Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332.4 ms