Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Clrn3Q8BHH8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Clrn3Q8BHH8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Clrn3Q8BHH8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Clrn3Q8BHH8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Clrn3Q8BHH8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Clrn3Q8BHH8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Clrn3Q8BHH8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Clrn3Q8BHH8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Clrn3Q8BHH8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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