Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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