Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ckap2lQ7TS74 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms