Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Eci3Q78JN3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms