Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rph3alQ768S4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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