Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtifQ6PEE2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms