Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms