Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srsf1Q6PDM2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms