Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9aQ68FE2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9aQ68FE2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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