Protein–RNA interactions for Protein: Q66X03

Nlrp9a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9aQ66X03 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nlrp9aQ66X03 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms