Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top2bQ64511 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms