Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms