Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim24Q64127 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms