Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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