Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SspnQ62147 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SspnQ62147 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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SspnQ62147 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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SspnQ62147 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SspnQ62147 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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