Protein–RNA interactions for Protein: Q61666

Hira, Protein HIRA, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HiraQ61666 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HiraQ61666 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HiraQ61666 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms