Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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PcolceQ61398 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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PcolceQ61398 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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PcolceQ61398 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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PcolceQ61398 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PcolceQ61398 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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