Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms