Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbbp4Q60972 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms