Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Traf3Q60803 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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