Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mkrn3Q60764 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms