Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms