Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prdm1Q60636 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prdm1Q60636 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms