Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tnfsf15Q5UBV8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms