Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim38Q5SZ99 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trim38Q5SZ99 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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