Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mdh1bQ5F204 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mdh1bQ5F204 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms