Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf608Q56A10 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms