Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms