Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ulk4Q3V129 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms